6畳なら空気を汚さない電気暖房がお勧めです。
ハロゲンヒーターかコタツか、というところで、
後は部屋の中でわりとウロウロしたいならヒーター、
じっと座っているのが殆どならコタツが一番電気代は少ないと思います。
でも朝起きた時や帰ってきた時はどうしても着替えなどでコタツには入れないので
ハロゲンヒーターや遠赤外線電気ストーブが一番便利かもしれません。
電気代はコタツと比べるとかかりますが、2時間程度なら大した額にはならないでしょう。
ちなみにうちの息子も6畳の洋室でハロゲンヒーターだけ使っています。
エアコンは飾り状態。それでもポカポカしていますよ。
もし扇風機をお持ちでないなら夏の事も考えてエアコンがいいと思いますよ。
購入金額は桁違いで高いけど1年中片付けなくていいし床面積は狭くならないのがいいですね。
最近の機種なら電気代はかなり安いそうです。